272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1473 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  49.81 
 
 
279 aa  268  9e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  46.07 
 
 
269 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  35.44 
 
 
302 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  1.51267e-06 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  35.61 
 
 
268 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  35.51 
 
 
275 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  30.53 
 
 
275 aa  138  9e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  36.1 
 
 
273 aa  138  9e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.8 
 
 
291 aa  136  3e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  36.16 
 
 
264 aa  134  1e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.12 
 
 
352 aa  129  5e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  35.69 
 
 
279 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  125  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  28.47 
 
 
283 aa  118  8e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  30.77 
 
 
283 aa  108  7e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  31.03 
 
 
302 aa  108  8e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  29.96 
 
 
270 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  33.08 
 
 
278 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  4.79797e-05 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  37.85 
 
 
287 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
279 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  27.08 
 
 
286 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
276 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  34.09 
 
 
283 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  26.21 
 
 
286 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  29.12 
 
 
280 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  4.70965e-06  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  31.78 
 
 
274 aa  99  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.36 
 
 
291 aa  98.6  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  30.13 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  35.75 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.68 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  30.16 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  34.39 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  30.11 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  30.11 
 
 
273 aa  92  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  30.5 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  5.29075e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
293 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  30.87 
 
 
289 aa  88.6  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  30.8 
 
 
274 aa  82.8  6e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  27.7 
 
 
292 aa  81.6  1e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.12 
 
 
278 aa  80.9  2e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  30.41 
 
 
274 aa  81.3  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
288 aa  81.3  2e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  25.83 
 
 
279 aa  81.3  2e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  24.42 
 
 
279 aa  80.1  4e-14  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  29.78 
 
 
280 aa  79.3  6e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  27.1 
 
 
323 aa  79  7e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  27.73 
 
 
276 aa  79  8e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  28.87 
 
 
319 aa  78.6  9e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  27.57 
 
 
277 aa  77.8  2e-13  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  31.47 
 
 
291 aa  77.4  2e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  30.22 
 
 
284 aa  76.3  4e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  22.18 
 
 
268 aa  76.6  4e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  31.22 
 
 
286 aa  76.3  5e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  24.56 
 
 
291 aa  75.9  6e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 
267 aa  75.9  6e-13  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  29.57 
 
 
299 aa  74.7  1e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  28.71 
 
 
293 aa  73.6  3e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  23.67 
 
 
268 aa  72.8  6e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  25.43 
 
 
270 aa  72  1e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  31.28 
 
 
294 aa  65.9  6e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
284 aa  64.7  2e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  28.16 
 
 
279 aa  63.9  3e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  24.37 
 
 
191 aa  62.4  8e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  27.06 
 
 
295 aa  62  9e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.88 
 
 
275 aa  62  1e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.07 
 
 
212 aa  58.9  8e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34.19 
 
 
253 aa  58.2  1e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  31.58 
 
 
240 aa  57.4  2e-07  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.92 
 
 
449 aa  57  3e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.57 
 
 
287 aa  57.4  3e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  42.5 
 
 
210 aa  55.8  7e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
255 aa  55.1  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 
255 aa  54.7  2e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  34.41 
 
 
261 aa  54.3  2e-06  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.08 
 
 
328 aa  53.5  3e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.46 
 
 
449 aa  53.5  4e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  38.6 
 
 
214 aa  52.8  6e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
256 aa  52.8  6e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
330 aa  52.4  7e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
330 aa  52.4  8e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
330 aa  52.4  8e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
190 aa  51.6  1e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 
257 aa  51.2  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
327 aa  51.2  2e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.78 
 
 
222 aa  50.8  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  25.26 
 
 
232 aa  51.2  2e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  25 
 
 
241 aa  51.2  2e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  33 
 
 
209 aa  51.2  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  27.33 
 
 
227 aa  51.2  2e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.06 
 
 
444 aa  51.2  2e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
280 aa  50.8  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  34.09 
 
 
121 aa  50.4  3e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  31 
 
 
263 aa  50.4  3e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  42.65 
 
 
230 aa  50.4  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  41.33 
 
 
246 aa  50.4  3e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  50.4  3e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  42.65 
 
 
250 aa  50.4  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
333 aa  50.1  4e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
329 aa  50.1  4e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>