More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1456 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  69.65 
 
 		 504 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  68.64 
 
 		 504 aa  709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  82.42 
 
 		 498 aa  849    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  71.66 
 
 		 502 aa  761    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  62.98 
 
 		 501 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 504 aa  1031    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  56.63 
 
 		 503 aa  594  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  54.71 
 
 		 509 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  56.02 
 
 		 503 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  55.42 
 
 		 503 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  54.91 
 
 		 500 aa  581  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  54.38 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  54.1 
 
 		 498 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  51.01 
 
 		 493 aa  548  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  51.93 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  50.51 
 
 		 490 aa  502  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  46.64 
 
 		 600 aa  458  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  44.99 
 
 		 546 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.46 
 
 		 522 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  41.93 
 
 		 529 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  40.52 
 
 		 522 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  40.12 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 		 527 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  42.4 
 
 		 525 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.88 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 		 523 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  41.91 
 
 		 529 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 		 529 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  40.28 
 
 		 524 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 		 534 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  43.85 
 
 		 521 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  38.15 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  42.96 
 
 		 561 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  36.4 
 
 		 554 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  34.24 
 
 		 527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  33.88 
 
 		 528 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  35.53 
 
 		 523 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  34.66 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  34.03 
 
 		 531 aa  276  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  34.17 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 547 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 547 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 547 aa  272  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  34.03 
 
 		 546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  37.39 
 
 		 532 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  32.99 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  34.79 
 
 		 547 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  33.68 
 
 		 553 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 543 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  33.26 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  34.79 
 
 		 542 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  32.64 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 		 527 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  35.6 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  33.41 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  34.19 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  31.33 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  33.26 
 
 		 430 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  31.76 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  30.31 
 
 		 490 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  32.11 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 471 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  25.57 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  28.88 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 		 486 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  26.08 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.85 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.95 
 
 		 471 aa  140  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 477 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.85 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 472 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.13 
 
 		 472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 451 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 477 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  26.08 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 		 441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  27.82 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.56 
 
 		 441 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>