217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1424 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 444 aa  883    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  58.78 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  54.73 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  46.52 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  41.92 
 
 		 449 aa  339  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  44.5 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  41.71 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  36.38 
 
 		 451 aa  299  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  38.43 
 
 		 448 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  37.67 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  36.24 
 
 		 482 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  38.57 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  32.52 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  31.41 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.5 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  26.28 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  25.96 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.03 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  25.89 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  25.56 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  26.24 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  26.24 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  26.24 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  26.24 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  26.24 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  26.39 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  26.24 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  25.81 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  24.46 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  24.88 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  20.9 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  19.86 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  19.9 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 		 529 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 486 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  32.94 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 526 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  24.05 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  19.58 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  25.85 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  21.54 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.87 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  28.93 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  23.32 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 495 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.57 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.25 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>