More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1409 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  100 
 
 
269 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  61.8 
 
 
267 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  59.93 
 
 
267 aa  346  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  55.22 
 
 
271 aa  317  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  55.6 
 
 
273 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.32 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  31.33 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.9 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  28.85 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  30.06 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  33.63 
 
 
438 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  33.63 
 
 
431 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  25.59 
 
 
853 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  33.63 
 
 
370 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7199  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  42.35 
 
 
145 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.27 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  26 
 
 
392 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0517  methyltransferase type 12  33.55 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.29 
 
 
345 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  30.84 
 
 
524 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  26.22 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.76 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  28.22 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  28.73 
 
 
353 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  31.86 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.93 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  35.04 
 
 
342 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.3 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  24.5 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  25.44 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  25.93 
 
 
271 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 
249 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.54 
 
 
356 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 
281 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  25.16 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 
400 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
175 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  24 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 
264 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.6 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  27.86 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  27.56 
 
 
355 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.96 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.96 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 
400 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30.89 
 
 
342 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0410  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.404807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  34.82 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  26.67 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  27.52 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  26.86 
 
 
288 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 
256 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  34.62 
 
 
410 aa  48.9  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
273 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2642  Methyltransferase type 11  23.6 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350923  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  26.67 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.17 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  25.89 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
344 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.17 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  30.48 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.2 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  25.31 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  30.16 
 
 
5993 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  30.16 
 
 
5915 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>