More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1358 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
626 aa  1286    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  47.76 
 
 
609 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  42.76 
 
 
615 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  42.98 
 
 
616 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  39.31 
 
 
636 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  40.09 
 
 
618 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  38.88 
 
 
627 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  39.25 
 
 
650 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  36.36 
 
 
652 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  36.94 
 
 
593 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 
621 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 
621 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3117  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 
619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.39 
 
 
639 aa  126  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
647 aa  107  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.6 
 
 
623 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 
634 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 
659 aa  97.4  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.29 
 
 
659 aa  94  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  26.29 
 
 
663 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 
663 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  26.29 
 
 
663 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.29 
 
 
663 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.29 
 
 
663 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.29 
 
 
663 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 
686 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.1 
 
 
641 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.48 
 
 
650 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.48 
 
 
650 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 
706 aa  89.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  26.48 
 
 
650 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.48 
 
 
650 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 
699 aa  87.8  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.48 
 
 
650 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 
710 aa  87.8  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.63 
 
 
615 aa  87.4  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
688 aa  87  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.24 
 
 
614 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.66 
 
 
614 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.24 
 
 
614 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.14 
 
 
623 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.24 
 
 
614 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.24 
 
 
614 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.58 
 
 
656 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.31 
 
 
646 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 
731 aa  85.5  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.15 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 
615 aa  85.5  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32.09 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  22.63 
 
 
746 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.74 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.15 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.15 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.74 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.15 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  40.32 
 
 
613 aa  84.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  37.6 
 
 
617 aa  84.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.12 
 
 
614 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  30.97 
 
 
653 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.81 
 
 
614 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.06 
 
 
696 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 
611 aa  84  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.19 
 
 
631 aa  83.2  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 
655 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 
657 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.22 
 
 
696 aa  83.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 
653 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 
613 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.08 
 
 
633 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.77 
 
 
661 aa  82.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 
618 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 
653 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 
653 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 
682 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 
688 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  31.39 
 
 
616 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
653 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 
613 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 
653 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  28.83 
 
 
717 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 
617 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  26.04 
 
 
693 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  35.59 
 
 
628 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
634 aa  80.9  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.64 
 
 
631 aa  80.5  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 
593 aa  80.5  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 
681 aa  80.5  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  31.36 
 
 
659 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 
670 aa  80.5  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
652 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  35 
 
 
611 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 
710 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  28.25 
 
 
680 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 
665 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 
763 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 
707 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.57 
 
 
653 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 
637 aa  78.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 
624 aa  78.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>