More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1325 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  58.38 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  56.45 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  56.45 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  56.76 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  56.22 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  56.22 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  56.22 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  56.22 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  56.59 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  54.59 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  55.14 
 
 		 185 aa  204  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  54.05 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  54.05 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  54.05 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  53.51 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  52.97 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  53.55 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  53.55 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  52.15 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  54.05 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  50.81 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  50.81 
 
 		 201 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  50.81 
 
 		 201 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  52.17 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  52.72 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  53.04 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  49.2 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  50.81 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  52.46 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  48.39 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  51.48 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  51.91 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  49.46 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  45.9 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  45.36 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  52.31 
 
 		 129 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  43.78 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  44.44 
 
 		 207 aa  131  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  40.43 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  40.43 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  42.55 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  41.43 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  36.7 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.64 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  38.8 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  46.67 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.04 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.62 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  35.79 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  35.79 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.61 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  36.02 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.02 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  39.25 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.36 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  38.67 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.04 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  33.86 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.19 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  33.33 
 
 		 190 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  35.29 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  41.78 
 
 		 305 aa  97.8  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.45 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  34.57 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  32.8 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  32.29 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  32.8 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  35.33 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  35.2 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  35.45 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  34.76 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  39.04 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 185 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  33.51 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.78 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  30.11 
 
 		 190 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  34.92 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  35.45 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.91 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>