264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1316 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  47.34 
 
 		 813 aa  698    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  46.1 
 
 		 796 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  43.95 
 
 		 971 aa  681    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  64.83 
 
 		 784 aa  1042    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  48.02 
 
 		 925 aa  749    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  86.38 
 
 		 799 aa  1374    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  63.4 
 
 		 794 aa  1034    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  51.73 
 
 		 815 aa  731    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  64.05 
 
 		 788 aa  1031    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  61.14 
 
 		 786 aa  976    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  67.4 
 
 		 795 aa  1106    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  52.46 
 
 		 785 aa  734    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 796 aa  1628    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  63.37 
 
 		 809 aa  1026    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  64.31 
 
 		 768 aa  998    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  63.37 
 
 		 809 aa  1026    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  47.34 
 
 		 813 aa  698    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  42.05 
 
 		 778 aa  609  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  39.6 
 
 		 998 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  33.12 
 
 		 920 aa  436  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  67.35 
 
 		 154 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  30.52 
 
 		 455 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  70.09 
 
 		 195 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  31.5 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  30.75 
 
 		 479 aa  151  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  31.35 
 
 		 479 aa  151  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  30.82 
 
 		 479 aa  150  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  30.37 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  30.14 
 
 		 485 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  30.21 
 
 		 463 aa  134  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  50.62 
 
 		 279 aa  96.3  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  26.69 
 
 		 560 aa  90.1  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.33 
 
 		 560 aa  90.1  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  27.53 
 
 		 473 aa  87.8  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  25.69 
 
 		 551 aa  87.8  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 462 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.15 
 
 		 652 aa  87  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  26.2 
 
 		 815 aa  87  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  27.69 
 
 		 629 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.99 
 
 		 813 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  25.23 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  28.42 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.27 
 
 		 773 aa  84.3  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  27.03 
 
 		 548 aa  84.3  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  28.98 
 
 		 551 aa  84  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 654 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  25.72 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 		 647 aa  82.4  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.61 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  28.04 
 
 		 979 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  25.72 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.69 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  28.57 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  25.4 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  25.72 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.62 
 
 		 812 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  37.59 
 
 		 499 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  30.05 
 
 		 444 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  28.15 
 
 		 549 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  31.19 
 
 		 451 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  27.25 
 
 		 650 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  32.57 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  29.6 
 
 		 558 aa  80.1  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  33.15 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.97 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  23.71 
 
 		 993 aa  78.2  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.01 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  25.83 
 
 		 1053 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.8 
 
 		 974 aa  77.8  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  32 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  27.13 
 
 		 1058 aa  77  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  26.43 
 
 		 1077 aa  77  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  23.72 
 
 		 967 aa  76.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  34.48 
 
 		 488 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  30.32 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  33.12 
 
 		 590 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  34.46 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  25.64 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  31.84 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  30.41 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  34.04 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  34.04 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  34.81 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  25.8 
 
 		 1017 aa  74.7  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  27.88 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  25.15 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  34.53 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  30.06 
 
 		 666 aa  73.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  26.79 
 
 		 1287 aa  73.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  27.18 
 
 		 459 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  27.54 
 
 		 558 aa  73.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  26.8 
 
 		 531 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0021  hypothetical protein  51.72 
 
 		 105 aa  73.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  26.12 
 
 		 1043 aa  72.8  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  33.81 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  26.27 
 
 		 949 aa  72.8  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  27.12 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 585 aa  72.4  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  26.51 
 
 		 928 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>