More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1187 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  49.26 
 
 		 214 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  49.03 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  48.99 
 
 		 217 aa  184  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.49 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.99 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  39.78 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.06 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  41.36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  37.84 
 
 		 461 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  38.32 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.82 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  37.19 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  37.82 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  38.32 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 		 266 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  39.78 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  38.17 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  38.69 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  37.32 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  36.62 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.71 
 
 		 232 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  39.38 
 
 		 272 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  34.1 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  35.86 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  35.86 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  38.28 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  35.86 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  35.86 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  35.91 
 
 		 246 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  41.49 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  34.83 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  36.18 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  38.69 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.5 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  36.56 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  35.84 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  37.97 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  35.47 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  37.23 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  39.18 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  34.98 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  39.04 
 
 		 257 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  34.95 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  34.95 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  32.52 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  33.99 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  37.11 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1367  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.55 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>