57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1169 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 554 aa  1113    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  30.83 
 
 		 559 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  30.76 
 
 		 568 aa  180  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  30.95 
 
 		 559 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  30.28 
 
 		 566 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  30.14 
 
 		 558 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  28.34 
 
 		 591 aa  130  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  30.42 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  26.26 
 
 		 543 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  30.88 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  26.31 
 
 		 556 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  27.71 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  27.71 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  27.71 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  27.71 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  27.71 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  27.71 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  27.71 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  27.71 
 
 		 454 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  26.25 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  29.26 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  28.94 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  24.38 
 
 		 463 aa  97.8  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  29.14 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  29.61 
 
 		 453 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  29.07 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  29.07 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  28.75 
 
 		 453 aa  87.4  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  30.46 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  34.01 
 
 		 1334 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  33.81 
 
 		 1381 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  23.35 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 1198 aa  57  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  29.88 
 
 		 359 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  26.82 
 
 		 282 aa  54.3  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  28.46 
 
 		 238 aa  54.3  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1272 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  25.99 
 
 		 1237 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  27.27 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  26.62 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  47.62 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  37.21 
 
 		 349 aa  48.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  33.61 
 
 		 287 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  27.57 
 
 		 209 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 345 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  42.86 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  41.27 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  34.04 
 
 		 343 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  24.54 
 
 		 348 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  26.62 
 
 		 312 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  35.8 
 
 		 403 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 369 aa  43.9  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1949  hypothetical protein  28.26 
 
 		 580 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0268272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 358 aa  43.5  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  45.65 
 
 		 190 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>