More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1162 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  66.03 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  59.77 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  59.02 
 
 		 267 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  63.77 
 
 		 269 aa  317  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  63.98 
 
 		 265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  59.54 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  48.68 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  53.16 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  48.3 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  47.53 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 270 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  53.16 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  52.32 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  53.16 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  50.63 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  48.3 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  46.42 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  52.1 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  48.3 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  48.3 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  48.3 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  46.56 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  46.95 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  46.56 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  46.9 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  43.82 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  46.64 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  48.67 
 
 		 265 aa  225  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  45.11 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 271 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  45.04 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  46.41 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  46.39 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  43.61 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  45.25 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  43.89 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  48.11 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  51.63 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  46.33 
 
 		 263 aa  221  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  38.93 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  46.77 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  47.88 
 
 		 278 aa  218  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  46.99 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  49.79 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  46.99 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  41.98 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  47.88 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  42.22 
 
 		 276 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  44.19 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  43.82 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 285 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  47.15 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  46.15 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  40.84 
 
 		 257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>