More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1154 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  87.85 
 
 
182 aa  325  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  90.06 
 
 
182 aa  325  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  86.81 
 
 
183 aa  321  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  74.59 
 
 
182 aa  287  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2328  orotate phosphoribosyltransferase  77.9 
 
 
182 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1892  orotate phosphoribosyltransferase  77.9 
 
 
182 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  67.96 
 
 
185 aa  245  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  52.75 
 
 
186 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  53.3 
 
 
186 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 
189 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
189 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
186 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 
190 aa  190  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
193 aa  188  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 
187 aa  184  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
193 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3689  orotate phosphoribosyltransferase  47.18 
 
 
212 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.477212  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
183 aa  179  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
184 aa  160  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
203 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  45.68 
 
 
184 aa  147  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
206 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
190 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 
208 aa  145  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
198 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
201 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
185 aa  140  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
201 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 
194 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
187 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
187 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
202 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  41.99 
 
 
187 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
204 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 
179 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
194 aa  134  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
187 aa  134  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
187 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
186 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
215 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
186 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
195 aa  124  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
177 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2110  orotate phosphoribosyltransferase  42.62 
 
 
189 aa  122  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
192 aa  121  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1305  orotate phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
187 aa  121  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 
194 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
178 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  41.81 
 
 
196 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 
188 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38490  orotate phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
178 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4069  orotate phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
191 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
192 aa  111  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 
191 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
197 aa  107  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05620  orotate phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0920693  normal  0.821582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
179 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  39.33 
 
 
199 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 
179 aa  101  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2425  orotate phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
191 aa  97.4  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.205434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  41.22 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5893  phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  33.75 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
185 aa  84.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
185 aa  84.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5738  orotate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.65 
 
 
479 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.65 
 
 
479 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>