More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1137 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  317  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  40.6 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  36.84 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.84 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  42.73 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 		 232 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 225 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  34.46 
 
 		 209 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 		 181 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  38.84 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  36.67 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  33.79 
 
 		 191 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  38.94 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  34.81 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  36.05 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  34.72 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  35.43 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  36.52 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  36.52 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  41.59 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  30.72 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  35.65 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.65 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  34.15 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.65 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  32.35 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.14 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  34.78 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.65 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.12 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  36.84 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.17 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  31.34 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  42.22 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  32.58 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 204 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  31.06 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  31.06 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  33.85 
 
 		 189 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  34.68 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  34.13 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  31.06 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  27.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.71 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  36.04 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  33.08 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  30.83 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  34 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>