More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1093 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  87.07 
 
 		 119 aa  209  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  86.09 
 
 		 118 aa  207  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  81.74 
 
 		 118 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 		 118 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  76.52 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  76.52 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 115 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  156  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 118 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  58.47 
 
 		 118 aa  153  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  61.06 
 
 		 118 aa  153  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 116 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  58.82 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 114 aa  150  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  56.78 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 113 aa  147  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 113 aa  147  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 113 aa  147  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 119 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  146  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  54.62 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  54.62 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 116 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  53.78 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 114 aa  143  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  67.35 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  58.47 
 
 		 130 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  57.01 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  61.02 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  61.02 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  61.02 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  60.17 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  60.17 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  56.64 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 116 aa  136  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 116 aa  135  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  59.48 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  60.36 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  63.37 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  54.87 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 116 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 180 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>