80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1011 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  166  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  88.75 
 
 
210 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  62.86 
 
 
197 aa  97.1  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  50 
 
 
328 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  52.05 
 
 
342 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  42.5 
 
 
291 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  42.47 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  42.47 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  43.75 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  40.54 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  43.24 
 
 
342 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  44.93 
 
 
192 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  44.44 
 
 
369 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  38.16 
 
 
342 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  44.93 
 
 
356 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  44.93 
 
 
324 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  44.93 
 
 
324 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  34.57 
 
 
332 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  40.62 
 
 
345 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  39.47 
 
 
342 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  41.1 
 
 
334 aa  61.6  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  39.44 
 
 
331 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  35.62 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  36.11 
 
 
354 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  41.89 
 
 
334 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  39.39 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  36.84 
 
 
353 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  41.67 
 
 
350 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  40.58 
 
 
340 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  35.62 
 
 
336 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  38.36 
 
 
358 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  35.62 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  38.75 
 
 
327 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  39.51 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  38.36 
 
 
352 aa  57.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  36.25 
 
 
333 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  39.73 
 
 
242 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  36.49 
 
 
366 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  35.62 
 
 
344 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  47.17 
 
 
334 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  36.36 
 
 
281 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  31.25 
 
 
344 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  32.89 
 
 
339 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  33.77 
 
 
337 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  38.33 
 
 
335 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  35.14 
 
 
365 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  34.85 
 
 
337 aa  50.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  32.88 
 
 
256 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  34.33 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  40.98 
 
 
338 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  33.78 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  31.08 
 
 
341 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  32.43 
 
 
330 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  31.51 
 
 
345 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  31.51 
 
 
345 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  36.23 
 
 
319 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  35.48 
 
 
198 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  35.48 
 
 
330 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  31.51 
 
 
341 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  31.51 
 
 
342 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  34.25 
 
 
333 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  34.38 
 
 
361 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  31.25 
 
 
333 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  34.43 
 
 
329 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  35.71 
 
 
55 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  30.88 
 
 
340 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  25.97 
 
 
335 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  32.93 
 
 
352 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  34.85 
 
 
343 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  33.9 
 
 
336 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  29.21 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  27.42 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  36.21 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  32.88 
 
 
359 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  33.9 
 
 
334 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  29.85 
 
 
332 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  35.09 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  31.08 
 
 
336 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  23.53 
 
 
344 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>