193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0985 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
262 aa  533  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.74 
 
 
265 aa  242  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  46.89 
 
 
264 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  44.23 
 
 
262 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  44.96 
 
 
260 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  40.23 
 
 
262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  36.05 
 
 
269 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  30.29 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.83 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.09 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  28.7 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.44 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.8 
 
 
236 aa  88.6  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  29.82 
 
 
238 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  26.38 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  27.56 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  27.56 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  27.56 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.64 
 
 
241 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  27.03 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  27.03 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.62 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  25.98 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  27.36 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.36 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  31.6 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.07 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  28.1 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.29 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  31.92 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.57 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  29.36 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  31.07 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.83 
 
 
245 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  27.85 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  26.73 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  27.65 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  24.65 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  31.25 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  27.66 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  25.31 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  28.38 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.83 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.83 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.83 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.83 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.83 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.83 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.83 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  26.11 
 
 
249 aa  72  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  26.07 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  26.07 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  28.33 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  35.92 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  29.28 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  26.05 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  30 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  35.38 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.76 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.92 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.44 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  25.99 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  25.48 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  25.75 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  30.07 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.77 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.91 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0861  protein-disulfide isomerase  33.58 
 
 
167 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  30.64 
 
 
277 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  24.24 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  25.12 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.28 
 
 
241 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.88 
 
 
246 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.28 
 
 
241 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.28 
 
 
241 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  22.22 
 
 
293 aa  58.5  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.26 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.52 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2967  protein-disulfide isomerase  31.72 
 
 
159 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.63 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.46 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.23 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.11 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  27.41 
 
 
179 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.32 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.32 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.06 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.35 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.35 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0870  protein-disulfide isomerase  34.03 
 
 
164 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.35 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.28 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  24.05 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.09 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.88 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.32 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.77 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.74 
 
 
241 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  23.92 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>