More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0864 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  43 
 
 
209 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  42.79 
 
 
209 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  41.21 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  37.44 
 
 
219 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
210 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  42.21 
 
 
218 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  40.91 
 
 
215 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  41 
 
 
209 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 
218 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  40.2 
 
 
216 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  37.32 
 
 
219 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  36.71 
 
 
229 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  34.93 
 
 
208 aa  131  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  35.32 
 
 
200 aa  131  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  39.3 
 
 
214 aa  118  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  37.75 
 
 
207 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  34.34 
 
 
201 aa  115  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  34.43 
 
 
200 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  30.61 
 
 
199 aa  104  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  29.94 
 
 
200 aa  92  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  27.07 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
307 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.26 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  26.63 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.74 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  27.64 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  35.29 
 
 
293 aa  64.7  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
299 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
348 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
270 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.87 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.26 
 
 
257 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  30.96 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  25.87 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
309 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  28.97 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
250 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  28.41 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
250 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 
265 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
311 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  28.39 
 
 
273 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  29.91 
 
 
261 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
250 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.11 
 
 
250 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  32.74 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  26.7 
 
 
307 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.69 
 
 
252 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
349 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.7 
 
 
255 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  30.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  28 
 
 
254 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  24.11 
 
 
250 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  26.98 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  28 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  29.75 
 
 
354 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  27.05 
 
 
439 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  27.07 
 
 
265 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
269 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  28.8 
 
 
253 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  23.9 
 
 
264 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  24.73 
 
 
310 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
283 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  33.12 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  34.96 
 
 
314 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.51 
 
 
250 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
260 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
287 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
265 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.47 
 
 
238 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
269 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
272 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  26.4 
 
 
265 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  55.1  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  24.7 
 
 
327 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  24.69 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  24.38 
 
 
305 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  32.28 
 
 
447 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  25.15 
 
 
287 aa  54.7  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
326 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>