More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0783 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  693    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  49.58 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  48.43 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  38.15 
 
 		 361 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  33.13 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  32.94 
 
 		 353 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  32.34 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  31.44 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  30.64 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  33.82 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  31.21 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  32.95 
 
 		 355 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  36.95 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  36.95 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  33.13 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  32.66 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  32.37 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  32.37 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  32.37 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  32.22 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  29.04 
 
 		 394 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  32.92 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  33.53 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  30.82 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  31.38 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  31.23 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  29.85 
 
 		 353 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  32.09 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  31.96 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  31.53 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  31.53 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  31.53 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  31.14 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  33.23 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  31.53 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  31.53 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  31.53 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  31.53 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  32.39 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  30.84 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  31.12 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  29.25 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  31.96 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  32.19 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  29.25 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.67 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.62 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  31.39 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  27.38 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  30.15 
 
 		 352 aa  142  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  32.72 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  30.56 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  32.46 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  31.7 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  30.09 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  30.23 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  31.59 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  32.42 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  29.74 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  30.92 
 
 		 352 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  30.24 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  27.17 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  28.83 
 
 		 365 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  26.27 
 
 		 406 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  29.24 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.35 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.26 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  27.22 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  27.22 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  27.14 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  30.77 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  30.41 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  29.46 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 379 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  29.07 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  32.11 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  29.62 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  34.63 
 
 		 363 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  30.11 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  28.27 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  25.68 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  28.45 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  28.45 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  27.16 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  28.99 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  34.93 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  25.68 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  32.28 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  26.95 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  29.62 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  28.69 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  25.74 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  32.09 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>