16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0760 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  630  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000614648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  42.9 
 
 
314 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  39.62 
 
 
317 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  38.33 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  38.61 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  36.82 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  33.66 
 
 
315 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  30.27 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  25.88 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  25.41 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  26.23 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2974  hypothetical protein  23.78 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.324632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2652  hypothetical protein  24.09 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0372503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5337  hypothetical protein  20.96 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000137644  hitchhiker  0.000000122299 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  25.15 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  25.15 
 
 
193 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>