More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0720 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  59.13 
 
 
251 aa  264  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  56.04 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  53.85 
 
 
209 aa  241  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  53.62 
 
 
208 aa  231  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  53.14 
 
 
207 aa  230  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  49.28 
 
 
209 aa  221  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  49.28 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  46.12 
 
 
210 aa  202  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  48.34 
 
 
207 aa  191  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  45.67 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 
205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  44.78 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  43.6 
 
 
207 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  44.02 
 
 
213 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  44.71 
 
 
209 aa  175  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  41.75 
 
 
212 aa  174  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  40.87 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  42.99 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  43.35 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 
212 aa  171  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
214 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  41.26 
 
 
218 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 
218 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
214 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
214 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  42.18 
 
 
206 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
214 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
209 aa  168  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.92 
 
 
211 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 
209 aa  166  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
214 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
214 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  40 
 
 
217 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
214 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  43.35 
 
 
222 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 
212 aa  165  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.15 
 
 
216 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  41.43 
 
 
214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 
215 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  43.35 
 
 
224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  42.65 
 
 
222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  38.94 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  39.42 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 
214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  39.81 
 
 
218 aa  160  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  40.69 
 
 
214 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 
214 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  40.98 
 
 
212 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  41.15 
 
 
230 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
206 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
205 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
214 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  40.39 
 
 
222 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
206 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  40.69 
 
 
213 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.9 
 
 
215 aa  158  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
215 aa  158  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  41.78 
 
 
213 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  41.75 
 
 
214 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
214 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 
214 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  41.55 
 
 
211 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 
217 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 
214 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 
214 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  38.94 
 
 
213 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
235 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  39.42 
 
 
207 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  40.87 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
214 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
214 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
214 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
214 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
214 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
214 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
214 aa  154  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  40.78 
 
 
217 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.5 
 
 
214 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  37.98 
 
 
214 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  39.9 
 
 
213 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
214 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
238 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  36.97 
 
 
214 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 
215 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
213 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 
219 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>