More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0704 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 131 aa  269  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  84.73 
 
 		 131 aa  219  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  86.96 
 
 		 130 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  83.97 
 
 		 131 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  80.92 
 
 		 131 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  74.81 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  74.81 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  74.81 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  74.81 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  74.81 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 129 aa  202  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 131 aa  201  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  78.45 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  200  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  78.45 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  78.45 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0958  30S ribosomal protein S11  84.73 
 
 		 131 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3303  30S ribosomal protein S11  84.73 
 
 		 131 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  69.29 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 129 aa  196  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  76.34 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  75.4 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 129 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  193  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 130 aa  192  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 130 aa  192  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 130 aa  191  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  67.46 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  67.46 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  67.46 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  71.9 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 130 aa  186  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  69.53 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  69.53 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  69.53 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  69.53 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  69.53 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  69.53 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  70.31 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  68.75 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  184  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  183  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 130 aa  183  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 130 aa  183  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  70.73 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  68.03 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  68.03 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  67.19 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 133 aa  180  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  64.12 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 133 aa  179  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>