More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0695 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  72.07 
 
 		 179 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  260  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  68.16 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  67.04 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 180 aa  207  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 180 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  52.81 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  55.31 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  191  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 		 182 aa  187  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.04 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  51.46 
 
 		 182 aa  184  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 180 aa  183  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  50.56 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  51.48 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 187 aa  177  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  47.75 
 
 		 178 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  51.43 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  50.28 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  47.57 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  49.16 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  48.69 
 
 		 191 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  51.74 
 
 		 183 aa  175  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  45.95 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  51.93 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  51.93 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  51.93 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>