275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0688 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 62 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  67.74 
 
 		 62 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 62 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 		 62 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 		 62 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  50.85 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  49.09 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  49.23 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  50.91 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  49.15 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  49.09 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  49.09 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  47.69 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  46.55 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  47.69 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  47.69 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  43.55 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  47.54 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  51.92 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  45.76 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  42.11 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  43.75 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  51.92 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2166  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  62.16 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00738  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 69 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  41.38 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>