More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0679 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  97.06 
 
 		 102 aa  200  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  91.18 
 
 		 102 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  94.12 
 
 		 102 aa  194  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  94.12 
 
 		 102 aa  194  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  94.12 
 
 		 102 aa  193  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  93.14 
 
 		 102 aa  192  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  82.35 
 
 		 103 aa  173  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  80.2 
 
 		 102 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  81.37 
 
 		 104 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  81.63 
 
 		 123 aa  167  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  167  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  78.43 
 
 		 103 aa  167  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  78 
 
 		 101 aa  165  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  164  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  77.45 
 
 		 104 aa  164  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  79 
 
 		 103 aa  163  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  163  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  163  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  163  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  160  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  160  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  160  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  159  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  74 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  157  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  157  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  73.53 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1248  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  71.57 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4277  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000346918  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>