More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0669 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 140 aa  280  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  92.86 
 
 		 141 aa  265  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  91.43 
 
 		 140 aa  260  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  91.43 
 
 		 140 aa  260  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  86.43 
 
 		 141 aa  249  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  86.43 
 
 		 140 aa  249  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  86.43 
 
 		 140 aa  248  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  77.14 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  75.54 
 
 		 140 aa  218  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  73.57 
 
 		 141 aa  216  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  75 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 		 143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 		 143 aa  210  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  72.86 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  74.29 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  73.72 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  72.86 
 
 		 141 aa  207  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  74.29 
 
 		 143 aa  207  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 143 aa  206  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 		 140 aa  206  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  72.86 
 
 		 143 aa  205  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 141 aa  205  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 143 aa  204  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  72.46 
 
 		 143 aa  203  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  71.53 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  72.26 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  72.26 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  71.53 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  71.53 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1588  50S ribosomal protein L11  68.49 
 
 		 148 aa  201  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2275  50S ribosomal protein L11  68.49 
 
 		 148 aa  201  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  68.35 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2225  50S ribosomal protein L11  69.18 
 
 		 148 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2363  50S ribosomal protein L11  68.49 
 
 		 148 aa  201  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 153 aa  201  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 143 aa  200  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  200  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  200  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  69.34 
 
 		 141 aa  200  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 142 aa  200  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 140 aa  199  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0615  ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4559  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275981  normal  0.0500923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0193  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000186819  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  70.29 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>