More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0607 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  81.16 
 
 
138 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  73.19 
 
 
138 aa  214  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.01 
 
 
138 aa  204  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.01 
 
 
138 aa  204  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  69.57 
 
 
138 aa  201  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  68.12 
 
 
138 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  66.67 
 
 
138 aa  196  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.28 
 
 
138 aa  152  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.28 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.38 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.09 
 
 
134 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  43.17 
 
 
142 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.15 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.57 
 
 
134 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.17 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.26 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.31 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  44 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.27 
 
 
133 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.75 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.12 
 
 
132 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.62 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.54 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.54 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.69 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.46 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.46 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.54 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.72 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.69 
 
 
133 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.09 
 
 
140 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.25 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.94 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.06 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.59 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.61 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  34.85 
 
 
137 aa  76.6  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.64 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.88 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.06 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.23 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.29 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1932  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.97 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.12 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.77 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1237  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.82 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.82 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.03 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.85 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.34 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.82 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16181  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.02 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4134  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.06 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2161  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2377  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.22 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2451  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.83 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1532  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2843  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.27 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16411  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.22 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.662603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0503  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.53 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0445749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.83 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.3 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.86 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2172  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100722 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0522  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.25 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.508742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.29 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.64 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.71 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.24 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.64 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.15 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.64 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0337  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.86 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2406  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  40.74 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.385305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.31 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.92 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.44 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>