183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0600 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  87.91 
 
 
91 aa  162  1e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  82.42 
 
 
91 aa  153  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.50029e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  81.32 
 
 
91 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.4416e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  81.32 
 
 
91 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  80.22 
 
 
91 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  78.02 
 
 
91 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.92065e-05  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  73.63 
 
 
91 aa  140  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  70.93 
 
 
88 aa  129  2e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.29893e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  68.6 
 
 
88 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  72.22 
 
 
90 aa  83.2  1e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  65.71 
 
 
107 aa  83.2  1e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  48.1 
 
 
93 aa  81.3  5e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  61.04 
 
 
96 aa  80.9  6e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  69.09 
 
 
109 aa  80.1  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  67.27 
 
 
106 aa  79  2e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.84566e-06  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  67.27 
 
 
109 aa  76.6  1e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  44.3 
 
 
96 aa  74.3  5e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  48.61 
 
 
111 aa  73.9  6e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  48.61 
 
 
82 aa  73.9  7e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  48.61 
 
 
82 aa  73.9  7e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  51.39 
 
 
100 aa  73.2  1e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  48.61 
 
 
122 aa  72.4  2e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  51.35 
 
 
88 aa  72.8  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  57.63 
 
 
107 aa  72  3e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  48.57 
 
 
95 aa  72  3e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  48.57 
 
 
93 aa  71.2  5e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  56.67 
 
 
91 aa  70.5  8e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  44 
 
 
93 aa  70.5  8e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  66.67 
 
 
101 aa  70.1  1e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 
92 aa  70.1  1e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 
81 aa  70.1  1e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 
82 aa  70.1  1e-11  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 
81 aa  68.9  2e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  46.75 
 
 
107 aa  68.9  2e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 
81 aa  68.6  3e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 
81 aa  68.6  3e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  45.71 
 
 
93 aa  68.6  3e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 
91 aa  68.6  3e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  60 
 
 
88 aa  68.6  3e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  51.39 
 
 
112 aa  68.2  4e-11  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  51.39 
 
 
112 aa  67.8  4e-11  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  51.39 
 
 
112 aa  68.2  4e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  46.27 
 
 
93 aa  68.2  4e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  47.3 
 
 
100 aa  67.8  5e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  52.11 
 
 
83 aa  67.4  6e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  1.10269e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  56.36 
 
 
82 aa  66.2  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  56.36 
 
 
81 aa  66.6  1e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 
81 aa  65.9  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  50.85 
 
 
81 aa  65.1  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  1.40393e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  50.85 
 
 
81 aa  65.1  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  49.32 
 
 
93 aa  65.1  4e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0957  F0F1 ATP synthase subunit C  58.82 
 
 
100 aa  64.3  5e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  46.97 
 
 
103 aa  64.3  5e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1502  F0F1 ATP synthase subunit C  58.82 
 
 
100 aa  64.3  5e-10  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 
82 aa  64.7  5e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
93 aa  63.9  7e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  47.89 
 
 
82 aa  63.9  8e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4471  H+transporting two-sector ATPase C subunit  56.25 
 
 
114 aa  62.8  1e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 
86 aa  62  3e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  47.44 
 
 
80 aa  61.6  3e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0429  F0F1 ATP synthase subunit C  58.18 
 
 
104 aa  60.8  7e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  3.98633e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  38.16 
 
 
321 aa  60.5  7e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  48.44 
 
 
90 aa  60.5  8e-09  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  45.59 
 
 
82 aa  60.1  9e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  45.59 
 
 
82 aa  60.1  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  53.06 
 
 
109 aa  59.3  2e-08  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  47.06 
 
 
83 aa  59.3  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0646  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  61.9 
 
 
93 aa  57  8e-08  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.643496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
93 aa  56.6  1e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  40.79 
 
 
94 aa  55.5  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 
83 aa  55.1  3e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  40.32 
 
 
74 aa  55.1  4e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
82 aa  54.3  5e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
82 aa  54.3  5e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
82 aa  54.3  5e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
82 aa  54.3  5e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
82 aa  54.3  5e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
82 aa  54.3  5e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  34.67 
 
 
96 aa  53.9  7e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  44.26 
 
 
185 aa  53.9  8e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  38.16 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 
76 aa  53.1  1e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.06 
 
 
85 aa  53.1  1e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
78 aa  52.8  1e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 
73 aa  52.4  2e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.3986e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  48.39 
 
 
75 aa  52.8  2e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  38.16 
 
 
76 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  38.16 
 
 
76 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 
73 aa  52.8  2e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  3.18758e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.37 
 
 
78 aa  52.4  2e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 
75 aa  51.6  3e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  40.68 
 
 
101 aa  51.6  3e-06  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 
77 aa  51.6  4e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 
72 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 
72 aa  51.2  5e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>