More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0584 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  100 
 
 
284 aa  567  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  73.76 
 
 
282 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  61.27 
 
 
278 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  59.86 
 
 
279 aa  329  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  59.86 
 
 
279 aa  328  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  58.87 
 
 
279 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  59.19 
 
 
269 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  50.7 
 
 
284 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  45.73 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  47 
 
 
298 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  47.22 
 
 
298 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  47.22 
 
 
298 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  45.61 
 
 
298 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.64 
 
 
286 aa  225  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  43.57 
 
 
285 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  41.84 
 
 
286 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  41.84 
 
 
286 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  45.14 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  45.14 
 
 
290 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  41.75 
 
 
295 aa  218  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  43.11 
 
 
292 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  44.04 
 
 
310 aa  214  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  47.02 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  41.37 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  43.31 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  41.58 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  42.91 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  45.68 
 
 
272 aa  212  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  42.05 
 
 
289 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  42.27 
 
 
299 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  42.86 
 
 
292 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  43.42 
 
 
282 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  41.57 
 
 
289 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.25 
 
 
284 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  45.58 
 
 
290 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.66 
 
 
290 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.66 
 
 
290 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  43.46 
 
 
294 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  44.37 
 
 
290 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  44.88 
 
 
289 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.28 
 
 
305 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  39.55 
 
 
322 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  43.66 
 
 
291 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  42.76 
 
 
286 aa  207  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  39.6 
 
 
299 aa  205  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  41.84 
 
 
297 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  42.16 
 
 
294 aa  205  8e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  42.45 
 
 
280 aa  204  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40.88 
 
 
321 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  41.96 
 
 
299 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  42.29 
 
 
300 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  42.29 
 
 
296 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  42.29 
 
 
301 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  43.11 
 
 
294 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  41.34 
 
 
281 aa  202  7e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  44.4 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  48.36 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.65 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  41.69 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  41.9 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  43.58 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.57 
 
 
283 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  40.71 
 
 
283 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  38.03 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  44.14 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  40.77 
 
 
283 aa  199  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  40.36 
 
 
280 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  39.48 
 
 
307 aa  198  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  39.72 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.36 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  40 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40.13 
 
 
323 aa  198  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  40.21 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  39.72 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  42.19 
 
 
329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  42.25 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  43.82 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  44.48 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  39.43 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  42.01 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  40.57 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  39.67 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  42.55 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  42.56 
 
 
297 aa  196  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  41.5 
 
 
296 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  39.72 
 
 
283 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.34 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  40.77 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  41.67 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.84 
 
 
286 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39.8 
 
 
314 aa  195  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  44.23 
 
 
294 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  41.04 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  37.63 
 
 
294 aa  194  9e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  42.76 
 
 
290 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  41.55 
 
 
292 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  42.66 
 
 
292 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  42.76 
 
 
290 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  40.48 
 
 
301 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  39.85 
 
 
305 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>