More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0535 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  100 
 
 		 550 aa  1092    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  46.2 
 
 		 552 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3220  General secretory system II protein E domain protein  47.25 
 
 		 550 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  43.76 
 
 		 552 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  43.4 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3401  general secretory system II, protein E-like  45.09 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  44.63 
 
 		 549 aa  435  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  25.96 
 
 		 558 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  25.61 
 
 		 570 aa  173  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  28.81 
 
 		 688 aa  163  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  25.13 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  27.47 
 
 		 553 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  24.54 
 
 		 599 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  26.57 
 
 		 589 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  24.06 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  26.22 
 
 		 568 aa  160  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  24.54 
 
 		 599 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  26.3 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  24.3 
 
 		 567 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  24.54 
 
 		 599 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  23.19 
 
 		 787 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  21.27 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  25.64 
 
 		 547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  24.51 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  25.89 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.78 
 
 		 563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  23.53 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  22.7 
 
 		 562 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  25.09 
 
 		 557 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  23.57 
 
 		 571 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  26.32 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.35 
 
 		 568 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  24.69 
 
 		 577 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  25.18 
 
 		 568 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.18 
 
 		 568 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  22.52 
 
 		 871 aa  146  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  23.09 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  24.24 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  23.4 
 
 		 570 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  25.71 
 
 		 568 aa  143  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  25.14 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  24.29 
 
 		 566 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.78 
 
 		 571 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  25.62 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.04 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  23.87 
 
 		 553 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  25.25 
 
 		 554 aa  137  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  23.97 
 
 		 556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  24.82 
 
 		 885 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  25.27 
 
 		 569 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.15 
 
 		 568 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  22.62 
 
 		 563 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  25.09 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.11 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  22.94 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  24.51 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  23.73 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  25.64 
 
 		 568 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  24.05 
 
 		 552 aa  130  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.96 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  25.39 
 
 		 577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  24.26 
 
 		 561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.25 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  23.99 
 
 		 582 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  25.36 
 
 		 891 aa  128  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  23.42 
 
 		 561 aa  128  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  23.17 
 
 		 545 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  22.39 
 
 		 570 aa  126  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  23.99 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  23.61 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  23 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  25.33 
 
 		 574 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  23.62 
 
 		 567 aa  124  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  22.5 
 
 		 577 aa  123  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  23.43 
 
 		 584 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  22.86 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  26.86 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.74 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  23.74 
 
 		 573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  23.72 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  24.73 
 
 		 572 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  23.82 
 
 		 560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  25.58 
 
 		 571 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  24.51 
 
 		 574 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  23.99 
 
 		 612 aa  120  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0872  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway PilB-like  23.4 
 
 		 548 aa  120  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  24.16 
 
 		 577 aa  120  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  22.36 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  24.32 
 
 		 574 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  22.27 
 
 		 565 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  24.05 
 
 		 585 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  24.77 
 
 		 578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  23.94 
 
 		 550 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  22.52 
 
 		 563 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  20.97 
 
 		 595 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  24.05 
 
 		 586 aa  117  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  24.1 
 
 		 586 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  25.49 
 
 		 585 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  24.6 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  21.37 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>