More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0449 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  72.41 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  72.6 
 
 		 146 aa  204  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  73.83 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  73.29 
 
 		 146 aa  200  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  71.62 
 
 		 148 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  67.12 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  65.31 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  57.64 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  54.11 
 
 		 161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  53.85 
 
 		 157 aa  163  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  56.94 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  56.94 
 
 		 139 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  54.73 
 
 		 164 aa  151  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  64.49 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  53.47 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  51.92 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  50 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  51.92 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  52.7 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  61.21 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  63.55 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  63.55 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  50.32 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  48.5 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  51.72 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  47.16 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  58.88 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  61.68 
 
 		 185 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  46.59 
 
 		 173 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  61.68 
 
 		 185 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  50.94 
 
 		 163 aa  143  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 		 178 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  62.86 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  52.03 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  57.63 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  52.5 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  48.77 
 
 		 166 aa  141  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  43.45 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  50 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  49.67 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 199 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  62.86 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 185 aa  137  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 179 aa  137  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 184 aa  137  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 196 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 179 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 183 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 186 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 184 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 184 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  49.01 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  62.96 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  58.65 
 
 		 196 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  47.55 
 
 		 200 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  44.59 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  40.64 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  46.36 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  49.01 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  51.47 
 
 		 175 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  49.65 
 
 		 238 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  46.75 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  46.2 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  48.95 
 
 		 231 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  48.5 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  54.1 
 
 		 242 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  59.81 
 
 		 183 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4247  single-strand binding protein  52.24 
 
 		 246 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.301307  hitchhiker  0.0000000000394233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  53.97 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  46.5 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  49.32 
 
 		 234 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  43.48 
 
 		 160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  49.32 
 
 		 236 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  49.32 
 
 		 234 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  49.32 
 
 		 234 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  49.32 
 
 		 236 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  46.06 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  54.7 
 
 		 183 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  43.6 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  53.03 
 
 		 222 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  50.82 
 
 		 190 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  46.21 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  58.04 
 
 		 234 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  58.88 
 
 		 189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5049  single-stranded DNA-binding protein  58.88 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>