73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0219 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  75.34 
 
 		 301 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  36.3 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  34.55 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0597  transcriptional regulator, putative  31.43 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4729  regulatory protein DeoR  31.85 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0512  regulatory protein, DeoR  29.28 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413197 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0952  transcriptional regulator protein-like protein  25.84 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3405  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3204  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4799  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.326133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  27.9 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0758  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0826  aspartate ammonia-lyase  29.71 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00181727  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0918  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  25 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1041  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3434  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2884  regulatory protein DeoR  30.27 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1387  regulatory protein DeoR  30.16 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0084  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.499568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.26 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.7 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0891  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  26.71 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.05 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  28.81 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  27.99 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.31 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  25.15 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  23.41 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.84 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  21.81 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.38 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.39 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0351  hypothetical protein  23.53 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.84 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  22.43 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  22.84 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.83 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.43 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  21.18 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  21.18 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  23.53 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3355  transcriptional regulator protein-like protein  45.45 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  27.27 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.81 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1028  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.43 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  25.63 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.03 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  24.38 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  28.19 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.07 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.19 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.23 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  22.52 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3763  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.64 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  23.9 
 
 		 687 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  22.07 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.38 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.75 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.33 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  22.56 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.66 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.5 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  24.74 
 
 		 326 aa  42.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  24.66 
 
 		 1078 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>