More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0216 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  98.77 
 
 		 163 aa  331  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  86.5 
 
 		 163 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  74.34 
 
 		 168 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  63.86 
 
 		 166 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  58.02 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  57.06 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  56.96 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  67.48 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  64.23 
 
 		 228 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  64.84 
 
 		 229 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  51.97 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  60.98 
 
 		 230 aa  150  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  56.39 
 
 		 231 aa  150  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  56.39 
 
 		 231 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  54.47 
 
 		 236 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  52.94 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  45.95 
 
 		 230 aa  133  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  52.03 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  47.97 
 
 		 229 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  50.41 
 
 		 227 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  43.59 
 
 		 169 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  56.36 
 
 		 225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  53.45 
 
 		 229 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  46.62 
 
 		 227 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 233 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  48.36 
 
 		 227 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  50.75 
 
 		 233 aa  130  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 226 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 226 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  55.45 
 
 		 225 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  51.26 
 
 		 231 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  55.45 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  55.45 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  55.45 
 
 		 225 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  52.1 
 
 		 229 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  48.41 
 
 		 241 aa  127  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  54.63 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  43.57 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 227 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  44.35 
 
 		 232 aa  124  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  48.74 
 
 		 228 aa  124  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  48.74 
 
 		 228 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 227 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  49.11 
 
 		 229 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  55.24 
 
 		 222 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  51.43 
 
 		 222 aa  121  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  47.06 
 
 		 222 aa  120  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  45.71 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  48.74 
 
 		 228 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  43.9 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  45.26 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  43.2 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  51.96 
 
 		 232 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  42.11 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  52.38 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  47.32 
 
 		 223 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  50.96 
 
 		 223 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  47.32 
 
 		 224 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  45.9 
 
 		 223 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  48.57 
 
 		 223 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  51.22 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  42.74 
 
 		 222 aa  111  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  41.94 
 
 		 220 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  45.08 
 
 		 234 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3561  DNA repair protein RadC  37.32 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  48.74 
 
 		 224 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1181  DNA repair protein RadC  45.9 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.426303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  45.08 
 
 		 224 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  39.86 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  39.86 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  39.86 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  39.86 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  39.86 
 
 		 222 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  39.86 
 
 		 222 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  40.65 
 
 		 222 aa  107  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4745  DNA repair protein RadC  42.62 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0218895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  43.44 
 
 		 225 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  43.09 
 
 		 226 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 222 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2347  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00287634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  46.3 
 
 		 234 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  47.32 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  39.13 
 
 		 222 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1383  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2888  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  47.57 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3538  DNA repair protein RadC  37.58 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  40.52 
 
 		 215 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  44.76 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  45.38 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>