More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0200 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  97.84 
 
 		 139 aa  283  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  97.12 
 
 		 139 aa  279  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  77.57 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  72.73 
 
 		 148 aa  176  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  71.82 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  67.29 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  67.29 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  70.09 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  56.94 
 
 		 143 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  56.94 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  64.49 
 
 		 167 aa  156  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  50 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  59.63 
 
 		 200 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  54.24 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  62.04 
 
 		 173 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  60.53 
 
 		 242 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  61.11 
 
 		 183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  60.58 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  46.85 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  53.78 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  50 
 
 		 238 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  55.17 
 
 		 231 aa  143  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  57.94 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  54.1 
 
 		 188 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  57.94 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  55.08 
 
 		 222 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  60.18 
 
 		 220 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  57.55 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  57.01 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  50.81 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  48.99 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 152 aa  139  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  60.18 
 
 		 225 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  57.52 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  48.25 
 
 		 234 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  55.65 
 
 		 236 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  48.25 
 
 		 234 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  48.25 
 
 		 234 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  55.65 
 
 		 236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  59.29 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  59.05 
 
 		 234 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  48.91 
 
 		 190 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 182 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 196 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 199 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  54.84 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 192 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 192 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 179 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 236 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 161 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  48.89 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 236 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 235 aa  135  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  59.05 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  53.72 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  53.72 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  59.05 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  48.7 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  60.36 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  56.9 
 
 		 165 aa  133  6.0000000000000005e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  58.1 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  55.08 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  55.08 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  55.08 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  55.08 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  55.08 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  55.08 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  55.08 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  55.08 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  57.41 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  55.08 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  51.24 
 
 		 222 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  47.33 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  60 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  53.98 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  53.23 
 
 		 177 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  54.46 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  47.33 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  55.86 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  60.19 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  53.28 
 
 		 165 aa  129  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>