More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0147 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  91.49 
 
 
236 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  91.49 
 
 
236 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  91.49 
 
 
236 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  91.06 
 
 
236 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  88.51 
 
 
236 aa  424  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  88.94 
 
 
236 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  82.55 
 
 
236 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  85.34 
 
 
234 aa  394  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  84.26 
 
 
236 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  84.26 
 
 
236 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  88.36 
 
 
244 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  82.68 
 
 
245 aa  390  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  81.39 
 
 
243 aa  384  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  80.69 
 
 
244 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  83.12 
 
 
236 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  80.35 
 
 
234 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  82.83 
 
 
235 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  81.66 
 
 
234 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  78.54 
 
 
243 aa  377  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  78.54 
 
 
244 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  79.65 
 
 
241 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  47.19 
 
 
237 aa  236  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  52.75 
 
 
235 aa  222  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  89.26 
 
 
122 aa  222  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  49.31 
 
 
228 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  47.03 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  47.49 
 
 
233 aa  215  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  48.4 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  52.29 
 
 
230 aa  208  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
234 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.98 
 
 
228 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  50.46 
 
 
254 aa  181  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  43.06 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
229 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
239 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.36 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  42.4 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  42.86 
 
 
654 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.47 
 
 
229 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
223 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  39.73 
 
 
228 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 
242 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.24 
 
 
232 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
223 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.12 
 
 
248 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  40.18 
 
 
223 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.95 
 
 
230 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.12 
 
 
248 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
228 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.18 
 
 
242 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 
223 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
223 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 
223 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  43.97 
 
 
329 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.33 
 
 
644 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.47 
 
 
234 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
227 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
223 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  41.2 
 
 
223 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
259 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.12 
 
 
228 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  41.89 
 
 
228 aa  168  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.41 
 
 
239 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 
221 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.86 
 
 
225 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
238 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  39.46 
 
 
238 aa  168  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
228 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  41.96 
 
 
225 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
223 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.41 
 
 
649 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.83 
 
 
642 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.26 
 
 
227 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  41.52 
 
 
233 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.52 
 
 
233 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  42.03 
 
 
258 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.41 
 
 
649 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
233 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.15 
 
 
225 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
233 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  41.52 
 
 
233 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
233 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
233 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.26 
 
 
227 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  42.92 
 
 
225 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
233 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.15 
 
 
225 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  38.46 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  38.46 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  40.71 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.45 
 
 
642 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  39.91 
 
 
227 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  43.38 
 
 
244 aa  165  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>