14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0100 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  31.47 
 
 		 340 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  29.35 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  29.7 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  28.64 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  30.33 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  28.64 
 
 		 364 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  29.19 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  28.43 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  26.89 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  33.71 
 
 		 343 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  24.88 
 
 		 346 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  32.58 
 
 		 341 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  26.96 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>