More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0091 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
854 aa  1742    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0806  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 
865 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.613384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
430 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  34.77 
 
 
1053 aa  202  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
651 aa  202  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
578 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  32.39 
 
 
515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  39.68 
 
 
563 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
547 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
444 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
590 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
539 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.0899176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
887 aa  173  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
536 aa  173  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1340 aa  171  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
579 aa  169  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.58 
 
 
591 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1193 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  36.72 
 
 
582 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
499 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3363  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
515 aa  166  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
590 aa  165  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.128603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
626 aa  164  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
627 aa  164  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  33.59 
 
 
537 aa  163  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  32.11 
 
 
842 aa  163  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
632 aa  163  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 
1193 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  30.23 
 
 
1439 aa  160  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 
1622 aa  159  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
478 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.52 
 
 
779 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0386  two component sensor kinase  35.86 
 
 
495 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
761 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
566 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
713 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
713 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
869 aa  154  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
916 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.23 
 
 
779 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
384 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
632 aa  152  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.13 
 
 
778 aa  152  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
929 aa  152  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
488 aa  151  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
712 aa  151  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.65 
 
 
785 aa  150  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.86 
 
 
784 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
520 aa  150  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
504 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  34.62 
 
 
538 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
831 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
761 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
1166 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.91 
 
 
778 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.64 
 
 
786 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
770 aa  149  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
1166 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
510 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
575 aa  149  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  30.43 
 
 
632 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.68 
 
 
778 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
532 aa  148  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
751 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
1807 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
1669 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
1267 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
704 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
1354 aa  145  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
714 aa  145  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
877 aa  145  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
506 aa  145  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
361 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
930 aa  144  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  27.85 
 
 
683 aa  144  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
632 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
502 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
510 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
871 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.81 
 
 
779 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
1116 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
664 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
385 aa  141  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
1140 aa  140  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
662 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
380 aa  140  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1341  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
495 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0234409  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
821 aa  140  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
1177 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
778 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
368 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0150  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
494 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.97 
 
 
778 aa  139  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  27.97 
 
 
778 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.97 
 
 
778 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.97 
 
 
778 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.97 
 
 
778 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1783  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
494 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.992798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>