127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0086 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
212 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.6 
 
 
213 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.97 
 
 
223 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.05 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.74 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.78 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  28.57 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  28.57 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  28.57 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  28.57 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.86 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.7 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.32 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.02 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.72 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.35 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.35 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.72 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.76 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.76 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.76 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.92 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  31.17 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.77 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  32.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  32.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  32.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  32.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  32.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  32.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  32.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.64 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.5 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.29 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.5 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  27.55 
 
 
334 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
331 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.45 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  26.34 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  26.53 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.61 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.11 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.26 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  25.17 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  29.06 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  30 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  30.1 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  25 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.64 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  25 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.24 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.41 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.08 
 
 
331 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  30.34 
 
 
376 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.82 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  26.21 
 
 
331 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.1 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.92 
 
 
330 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  29.79 
 
 
339 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.2 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  20 
 
 
198 aa  58.5  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  31.58 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  26.8 
 
 
338 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
346 aa  55.5  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.56 
 
 
342 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.97 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.54 
 
 
546 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.32 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.86 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  29.01 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  29.37 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.21 
 
 
197 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.59 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.1 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.1 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.58 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  28.8 
 
 
344 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.33 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  36.49 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.83 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  24.5 
 
 
334 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  24.2 
 
 
546 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.01 
 
 
381 aa  48.5  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  24 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  24.2 
 
 
546 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  24.34 
 
 
546 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  24.34 
 
 
546 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  24.34 
 
 
546 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  24.34 
 
 
546 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>