More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0084 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  43.04 
 
 		 1600 aa  745    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1352 aa  2769    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  33.91 
 
 		 2096 aa  475  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  34.67 
 
 		 1271 aa  443  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  31.35 
 
 		 2149 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.99 
 
 		 3027 aa  322  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.33 
 
 		 1485 aa  306  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 		 2035 aa  303  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1197 aa  300  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1586 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  30.99 
 
 		 2277 aa  294  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1602 aa  288  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1840 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.11 
 
 		 1467 aa  284  6.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1959 aa  281  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1531 aa  280  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.95 
 
 		 1434 aa  278  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.49 
 
 		 1576 aa  278  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.77 
 
 		 1572 aa  277  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.37 
 
 		 1626 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1611 aa  276  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1917 aa  275  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1942 aa  275  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1147 aa  275  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1620 aa  274  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.09 
 
 		 1381 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.49 
 
 		 1488 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1554 aa  273  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.48 
 
 		 1362 aa  273  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.92 
 
 		 1981 aa  273  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.21 
 
 		 1595 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1669 aa  271  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.88 
 
 		 1259 aa  271  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1411 aa  270  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.97 
 
 		 1586 aa  268  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.74 
 
 		 1429 aa  268  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  28.73 
 
 		 1568 aa  266  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  29.86 
 
 		 2294 aa  264  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  27.7 
 
 		 2731 aa  263  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.83 
 
 		 1560 aa  263  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  30.58 
 
 		 2003 aa  263  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1487 aa  262  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1400 aa  262  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 3689 aa  261  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.16 
 
 		 1527 aa  260  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.14 
 
 		 924 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  25.3 
 
 		 1573 aa  258  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1551 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.07 
 
 		 1348 aa  258  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.64 
 
 		 1614 aa  258  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.11 
 
 		 1509 aa  257  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.18 
 
 		 1609 aa  256  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.68 
 
 		 1385 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1390 aa  253  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1495 aa  252  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.61 
 
 		 1579 aa  251  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.71 
 
 		 1494 aa  250  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1494 aa  250  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1550 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.48 
 
 		 1428 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.43 
 
 		 1379 aa  249  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  28.87 
 
 		 3193 aa  248  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1520 aa  248  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.01 
 
 		 1543 aa  247  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  29.33 
 
 		 927 aa  247  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  28.66 
 
 		 1953 aa  247  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  29.58 
 
 		 1008 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  29.58 
 
 		 1008 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1552 aa  246  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1547 aa  244  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.61 
 
 		 1495 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.63 
 
 		 1528 aa  241  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.35 
 
 		 1518 aa  241  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1409 aa  241  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  29.23 
 
 		 1345 aa  240  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  29.23 
 
 		 1345 aa  240  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.24 
 
 		 1485 aa  239  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.72 
 
 		 1508 aa  239  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  27.12 
 
 		 1160 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.34 
 
 		 1517 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  27.85 
 
 		 866 aa  236  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  28.28 
 
 		 1599 aa  235  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  26.4 
 
 		 1421 aa  233  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1541 aa  232  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1541 aa  232  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1541 aa  232  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1381 aa  231  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1386 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1541 aa  231  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.27 
 
 		 1384 aa  231  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1541 aa  230  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1541 aa  231  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  27.21 
 
 		 1447 aa  230  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  26.75 
 
 		 1998 aa  229  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.61 
 
 		 1446 aa  225  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.71 
 
 		 1489 aa  224  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.01 
 
 		 3073 aa  224  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1390 aa  224  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  29.25 
 
 		 913 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  28.7 
 
 		 867 aa  221  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>