252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0081 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  302  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  43.54 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  40.97 
 
 
148 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  44.06 
 
 
185 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  44.06 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  42.96 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  44.06 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  43.48 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 
155 aa  116  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  44.27 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  44.12 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
142 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
149 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  44.88 
 
 
132 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
149 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  46.96 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 
153 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  39.86 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  39.44 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
169 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  36.43 
 
 
145 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  42.22 
 
 
136 aa  95.9  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  41.41 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  38.97 
 
 
153 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  42.75 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  45 
 
 
124 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 
163 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  36 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  39.09 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  37.3 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
213 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  34.04 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  37.72 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  37.14 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  35.46 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  37.59 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  36.84 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  35.09 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  35.09 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  35.09 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  36.52 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  34.11 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.04 
 
 
238 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.96 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.04 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  35.09 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.04 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.04 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.04 
 
 
248 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  40.19 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.04 
 
 
374 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.64 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  29.23 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  35.78 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  36.84 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  32.79 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 
161 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  38.37 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  30.48 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  31.25 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  28.46 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  30.7 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.02 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  29.17 
 
 
142 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.14 
 
 
161 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>