218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0075 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0075  CheW protein  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  36.69 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0638  CheW protein  32.87 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07762e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0624  CheW protein  32.61 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  32.86 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  32.54 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  33.66 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  31.63 
 
 		 779 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  32.53 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  34.57 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  32.5 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  30 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  29.49 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.29 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3197  purine-binding chemotaxis protein CheW, putative  31.9 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  39.68 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.92 
 
 		 907 aa  50.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  28.05 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  28.87 
 
 		 295 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  36.67 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  27.88 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  27.88 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  26.92 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  25 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  32.81 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  39.34 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.88 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.88 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.81 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  37.33 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  37.8 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  38.46 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.17 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  35.53 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  38.46 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  37.33 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0080  CheW protein  28.74 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0672928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  38.46 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  27.68 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  27.55 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  36.11 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  23.93 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  31.82 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  39.47 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  34.92 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  38.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  26.5 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  26.83 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  34.92 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  28.05 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  34.92 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.27 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  29.25 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  37.5 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  34.92 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  34.92 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  26.32 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  28.06 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  27.64 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2533  CheW protein  33.77 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.25 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  25.47 
 
 		 515 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.2 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  33.9 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  36.59 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  33.71 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  28.57 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  34.62 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  34.62 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  26.67 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  27.17 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  35.19 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  21.9 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.17 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  34.62 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  32.2 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  31.54 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  25.25 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  24.79 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.21 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  27 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  26.09 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  35.59 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  27.37 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.2 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  24.27 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  28.72 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.33 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  24.75 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  33.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.36 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.17 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  32.43 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.32 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  25.81 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1843  CheW protein  32.88 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718513  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  30.4 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>