16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0073 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0073  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0751  hypothetical protein  66.48 
 
 
179 aa  263  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  39.11 
 
 
178 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  37.64 
 
 
179 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  31.77 
 
 
200 aa  94.7  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  31.4 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  27.75 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  30.81 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  27.18 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  28.1 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  25.39 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  22.5 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  24.04 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  24.32 
 
 
226 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0889  Protein of unknown function DUF2284, metal-binding protein  29.1 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  28.48 
 
 
215 aa  47.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>