28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0048 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  193  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  42.7 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  43.16 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  42.35 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  35.87 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  42.7 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  44.93 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  42.7 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  36.62 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  36.78 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2660  hypothetical protein  28.72 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0210491  decreased coverage  0.0010024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1281  hypothetical protein  31.76 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  34.83 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  28.26 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  27.47 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  36.84 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1584  hypothetical protein  39.13 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  26.44 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  30 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  24.05 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4547  hypothetical protein  30 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721986  normal  0.107379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2370  hypothetical protein  30.39 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.696423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4500  hypothetical protein  23.86 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2199  coenzyme PQQ synthesis D  23.08 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000481362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1214  hypothetical protein  23.94 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566757  normal  0.0801424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2555  hypothetical protein  23.94 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.924508  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  21.05 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3350  hypothetical protein  27.85 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>