More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0044 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  78.53 
 
 
387 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  80.1 
 
 
389 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  83.16 
 
 
388 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  78.53 
 
 
389 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  78.53 
 
 
389 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
388 aa  801    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  78.8 
 
 
389 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  73.82 
 
 
389 aa  604  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
388 aa  564  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  68.15 
 
 
389 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
387 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 
399 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  68.39 
 
 
389 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  66.06 
 
 
387 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  68.39 
 
 
389 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2850  S-adenosylmethionine synthetase  68.99 
 
 
388 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 
384 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  68.67 
 
 
384 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  68.67 
 
 
384 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
389 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  68.15 
 
 
384 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  67.89 
 
 
384 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  68.15 
 
 
384 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 
384 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  68.41 
 
 
384 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  65.57 
 
 
403 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 
384 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  68.15 
 
 
384 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 
384 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 
384 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 
384 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 
384 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
399 aa  541  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  65.74 
 
 
399 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
399 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
399 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  65.74 
 
 
399 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
399 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  65.23 
 
 
403 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  65.74 
 
 
399 aa  541  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  67.89 
 
 
384 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
399 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
399 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  65.74 
 
 
399 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
382 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3332  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 
389 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  67.19 
 
 
383 aa  534  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
396 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 
385 aa  537  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
383 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
396 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
395 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
395 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  68.6 
 
 
381 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
395 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  65.05 
 
 
396 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0078  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
395 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
395 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
395 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
395 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
395 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
395 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
395 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
395 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  64.81 
 
 
397 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
395 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
395 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
383 aa  531  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  64.97 
 
 
399 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
395 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
383 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
383 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3129  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
395 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
383 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
395 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  65.28 
 
 
396 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
383 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 
396 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  64.18 
 
 
403 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
407 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  65.45 
 
 
390 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  65.54 
 
 
387 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  64.6 
 
 
387 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 
383 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  63.29 
 
 
396 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 
393 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  64.45 
 
 
396 aa  527  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 
393 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0194  S-adenosylmethionine synthetase  65.87 
 
 
387 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.378325  hitchhiker  0.00256294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
383 aa  524  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  64.06 
 
 
385 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 
383 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  63.43 
 
 
402 aa  525  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
383 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  63.4 
 
 
388 aa  523  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  61.48 
 
 
395 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>