More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0042 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.26 
 
 		 563 aa  720    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 565 aa  1144    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  46.97 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  48.16 
 
 		 549 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 		 570 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.28 
 
 		 569 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.05 
 
 		 588 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.01 
 
 		 546 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.46 
 
 		 540 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.82 
 
 		 557 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.77 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.7 
 
 		 545 aa  349  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.49 
 
 		 547 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.48 
 
 		 540 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.65 
 
 		 547 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.21 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  50.84 
 
 		 544 aa  346  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.92 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.06 
 
 		 550 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.01 
 
 		 542 aa  343  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.85 
 
 		 661 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.26 
 
 		 547 aa  337  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  56.1 
 
 		 533 aa  335  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.44 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  59.87 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.78 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  55.52 
 
 		 541 aa  332  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.81 
 
 		 588 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.857462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.54 
 
 		 544 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  51.33 
 
 		 543 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  57.32 
 
 		 392 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.6 
 
 		 388 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  58.26 
 
 		 549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.05 
 
 		 544 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  50.13 
 
 		 632 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 		 544 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.35 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.19 
 
 		 392 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.27 
 
 		 541 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.13 
 
 		 538 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  52.66 
 
 		 645 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.04 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  48.86 
 
 		 539 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  52.56 
 
 		 539 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 		 392 aa  316  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.59 
 
 		 550 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 541 aa  313  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  48.55 
 
 		 528 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  55.1 
 
 		 541 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.24 
 
 		 700 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.85 
 
 		 549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.89 
 
 		 535 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.29 
 
 		 535 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 		 822 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.72 
 
 		 533 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.25 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.41 
 
 		 700 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.66 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.83 
 
 		 537 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.27 
 
 		 518 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 		 674 aa  290  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.74 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.57 
 
 		 666 aa  287  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.83 
 
 		 515 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 544 aa  280  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.38 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  43.82 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 564 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 		 540 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.86 
 
 		 658 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.39 
 
 		 554 aa  267  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  37.06 
 
 		 553 aa  267  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 554 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.51 
 
 		 544 aa  253  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.04 
 
 		 566 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.19 
 
 		 664 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.24 
 
 		 549 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  36.02 
 
 		 553 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.02 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.45 
 
 		 554 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  36.07 
 
 		 553 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.02 
 
 		 554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  32.01 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  32.75 
 
 		 557 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  30.62 
 
 		 564 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  31.79 
 
 		 559 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 554 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>