More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0003 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  100 
 
 		 370 aa  762    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  50.27 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  46.83 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  42.27 
 
 		 364 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.82 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  42.35 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  43.8 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.04 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.77 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  36.22 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.52 
 
 		 369 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.26 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.67 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  37.47 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  35.64 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  35.41 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  34.31 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  34.14 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  34.14 
 
 		 375 aa  215  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  34.14 
 
 		 375 aa  215  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  32.88 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  34.05 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  33.87 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  33.87 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  33.87 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  33.87 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  33.87 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  33.87 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.39 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.68 
 
 		 372 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  32.62 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.04 
 
 		 386 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  34.96 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  37.32 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  34.96 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  33.87 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.51 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.21 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  34.32 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  34.97 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.51 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  33.72 
 
 		 359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.38 
 
 		 365 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.89 
 
 		 376 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  33.62 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.07 
 
 		 373 aa  192  5e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  32.89 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  34.52 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  36.52 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  31.42 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  31.42 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  33.64 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  35.65 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  30.75 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  35.92 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  34.78 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  32.37 
 
 		 359 aa  179  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  32.24 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.13 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  32.97 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  30.41 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  35.96 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  35.96 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  32.97 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  32.97 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  32.97 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  32.33 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.53 
 
 		 363 aa  176  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  31.82 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.7 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  32.8 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  34.63 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  32.24 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  30.42 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  30.11 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  34.85 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  31.62 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  31.34 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  31.64 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  31.88 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  33.15 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  31.89 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  31.34 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  31.34 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  31.34 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  32.6 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  30.89 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.65 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.19 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  35.11 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03481  recombination protein F  32.43 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  28.37 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  31.35 
 
 		 367 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.99 
 
 		 359 aa  169  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  32.51 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  31.08 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  33.51 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  33.51 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>