More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2922 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 97 aa  200  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  79.49 
 
 		 94 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  69.57 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  65.98 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  67.03 
 
 		 92 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  71.05 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  57.89 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  54.17 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  48.1 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  47.56 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  60.94 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  41.67 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  57.14 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  57.14 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  48.65 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  51.39 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 		 75 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  48 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  51.43 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.25 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  40.96 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 		 79 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 		 79 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  52.11 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  53.85 
 
 		 72 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  47.37 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  50.7 
 
 		 92 aa  84.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  42.7 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  44.93 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  49.28 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  54.55 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  46.05 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  45.68 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  52.86 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  43.9 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2086  hypothetical protein  48.57 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  43.9 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  50.72 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  43.02 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  39.51 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  44.74 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  43.21 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  54.69 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  44.93 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  45.59 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  48.61 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  48.57 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  48.57 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  48.57 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  48.57 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  47.89 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.3 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  40.79 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  52.31 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  43.42 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  48.57 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  48.57 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  48.57 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  42.11 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  43.06 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  42.11 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  46.25 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  48.57 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.38 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  48.61 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  46.58 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>