278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2883 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
175 aa  342  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  85.14 
 
 
175 aa  300  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  82.29 
 
 
175 aa  293  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  81.71 
 
 
175 aa  290  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  85.14 
 
 
175 aa  283  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  78.29 
 
 
175 aa  279  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  73.14 
 
 
175 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  42.01 
 
 
171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  39.31 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  37.93 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  37.36 
 
 
179 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  37.93 
 
 
179 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  39.38 
 
 
164 aa  122  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  36.65 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  37.27 
 
 
167 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  36.08 
 
 
164 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  42.25 
 
 
164 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.68 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  32.68 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  32.69 
 
 
168 aa  94.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
238 aa  93.2  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  34.19 
 
 
171 aa  92  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  32.69 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  37.91 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  35.58 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
162 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  89  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  89  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  31.18 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  38.1 
 
 
151 aa  88.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
206 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
168 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  34 
 
 
152 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  33.1 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  29.48 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.48 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  36.6 
 
 
156 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  36.6 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  35.9 
 
 
165 aa  84.3  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  37.41 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  36.88 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  33.33 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  29.81 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  33.79 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  33.99 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  30.49 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.67 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  34 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>