More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2770 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1776  integral membrane protein TerC  74.7 
 
 
259 aa  391  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.221136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  71.03 
 
 
266 aa  359  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  69.41 
 
 
255 aa  349  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  61.22 
 
 
271 aa  331  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0990  Integral membrane protein TerC  45.27 
 
 
245 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1296  Integral membrane protein TerC  44.97 
 
 
245 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0964782  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1297  Integral membrane protein TerC  39.92 
 
 
235 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.308093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2785  membrane protein TerC  43.37 
 
 
284 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0578  Integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.592878 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0387  integral membrane protein TerC  38.97 
 
 
262 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0382  integral membrane protein TerC  39.42 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0339  integral membrane protein TerC  37.8 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4857  putative tellurium resistance protein  39.61 
 
 
263 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.002558  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0992  Integral membrane protein TerC  41.31 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0388  tellurium resistance protein  39.41 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000390174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0516  putative tellurium resistance protein  38.94 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000032211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0379  TerC family integral membrane protein  39.41 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000163216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0376  TerC family integral membrane protein  38.94 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0467  putative tellurium resistance protein  38.94 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0402  tellurium resistance protein  39.41 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.221092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0446  putative tellurium resistance protein  39.41 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4213  tellurium resistance protein TerC  35.87 
 
 
285 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537903  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0516  tellurium resistance protein, putative  38.46 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0443  tellurium resistance protein TerC  35.87 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1036  integral membrane protein TerC  36.24 
 
 
267 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1422  hypothetical protein  37.04 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1200  TerC family integral membrane protein  37.04 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3984  membrane protein, TerC family  37.04 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1360  membrane protein, TerC family  37.04 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1398  membrane protein, TerC family  37.04 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1202  TerC family integral membrane protein  37.04 
 
 
264 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0439285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1462  membrane protein, TerC family  37.04 
 
 
264 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1223  hypothetical protein  37.04 
 
 
266 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1322  hypothetical protein  37.04 
 
 
264 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1038  integral membrane protein TerC  33.2 
 
 
267 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00785586  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1824  integral membrane protein TerC  37.11 
 
 
251 aa  123  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1019  integral membrane protein TerC  33.2 
 
 
267 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1224  integral membrane protein TerC  37.04 
 
 
264 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0610  TerC family integral membrane protein  33.8 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00407754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1298  Integral membrane protein TerC  33.85 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.843516  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2572  tellurium resistance protein TerC  37.28 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0089  hypothetical protein  39.49 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2235  integral membrane protein TerC  31.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2829  Integral membrane protein TerC  33.33 
 
 
245 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0867019  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1304  TerC family protein  34.08 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.666261  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2338  Integral membrane protein TerC  29.12 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4409  Integral membrane protein TerC  33.16 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1578  integral membrane protein TerC  31.9 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22538  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0367  membrane protein TerC  34.81 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3425  hypothetical protein  30.77 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1844  Integral membrane protein TerC  30.14 
 
 
239 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4472  Integral membrane protein TerC  33.16 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10491  tellurium resistance protein TerC  34.08 
 
 
240 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120538  hitchhiker  0.00269947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2735  Integral membrane protein TerC  33.87 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3367  Integral membrane protein TerC  33.87 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.50286  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0960  hypothetical protein  34.43 
 
 
236 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0967888  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1171  TerC family protein  33.15 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10281  membrane protein TerC  34.43 
 
 
236 aa  85.5  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.919914  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10291  membrane protein TerC  33.88 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09161  tellurium resistance protein TerC  34.29 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0549  hypothetical protein  29.84 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1024  Integral membrane protein TerC  32.37 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0081641 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09251  tellurium resistance protein TerC  30.29 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0654271  hitchhiker  0.00000817994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  29.79 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  27.16 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  30.11 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  24.77 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  30.11 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  28.91 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0480576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  24.53 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  27.89 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  27.18 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  26.79 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  22.94 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  25 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  27.57 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  23.11 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1736  Integral membrane protein TerC  27.49 
 
 
369 aa  62  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.146696  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  24.06 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  24.06 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  24.06 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  24.06 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  24.06 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  25.68 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  24.53 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  25.43 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  29.11 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  27.5 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1409  integral membrane protein TerC  23.96 
 
 
220 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.207515  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  28.89 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1494  hypothetical protein  27.18 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>