More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2766 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  70.69 
 
 		 232 aa  341  7e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.81 
 
 		 232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.1 
 
 		 233 aa  317  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.23 
 
 		 232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  62.22 
 
 		 232 aa  276  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  58.87 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.84 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.12 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.12 
 
 		 235 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.53 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  44.93 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  43.86 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.36 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.7 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  33.79 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  42.03 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  36.36 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  32.37 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  33.33 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  31.86 
 
 		 366 aa  95.9  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  29.15 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29.96 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  32.88 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  28.7 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  27.8 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.92 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  34.76 
 
 		 321 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  29.95 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  31.56 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  31.1 
 
 		 300 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  34.53 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.38 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  41.27 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.38 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  28.18 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  32.26 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.73 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  33.65 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  36.73 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  32.55 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  26.58 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  32.38 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.19 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  30.84 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  29.18 
 
 		 308 aa  71.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  28.93 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  29.82 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  30.4 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  30.4 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  28.44 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  30.65 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  30.33 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  24.55 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  24.55 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.33 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 694 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  35.07 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  25.94 
 
 		 332 aa  62  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 294 aa  62  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  25.56 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.36 
 
 		 323 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  41.07 
 
 		 500 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  26.98 
 
 		 339 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.36 
 
 		 323 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.75 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  28.95 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  24.77 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.53 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.31 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  36.57 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  27.72 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  28.06 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.47 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>