50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2685 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 63 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  90.48 
 
 		 63 aa  123  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  85.71 
 
 		 63 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  80.95 
 
 		 63 aa  110  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  80.95 
 
 		 63 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  65.08 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  61.9 
 
 		 63 aa  88.2  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  39.66 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.44 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0267  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.82 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0300363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  41.86 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0684  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000000414413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  32.69 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  43.48 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  34.69 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  32.69 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  36.36 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3457  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  0.4312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 168 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>