More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2684 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  90.58 
 
 		 191 aa  357  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  89.01 
 
 		 191 aa  357  8e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  85.42 
 
 		 192 aa  344  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  87.43 
 
 		 191 aa  344  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  83.25 
 
 		 191 aa  334  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  80.83 
 
 		 193 aa  325  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  49.72 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  42.2 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  43.26 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  41.48 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  43.02 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  42.62 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  42.44 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  45.03 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  45.03 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  44.75 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  42.44 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  42.13 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  41.28 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  44.44 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  42.77 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  41.48 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  42.2 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  39.8 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  41.28 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  42.77 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  43.09 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 		 176 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  43.43 
 
 		 179 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  38.24 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  43.1 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  41.81 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  38.82 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 		 176 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1401  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  40.7 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  38.51 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  38 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  36.99 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  40.8 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  39.77 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  39.88 
 
 		 176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  41.28 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 		 176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 		 176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  40.57 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  39.18 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  37.78 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  40.46 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  41.62 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  41.38 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  40.46 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  40.7 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 		 176 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  36.61 
 
 		 266 aa  138  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  38.07 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  37.79 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  40.7 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  42.37 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  40.78 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  38.73 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  39.46 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  40.23 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  37.5 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  41.81 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  40.23 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  39.05 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  34.54 
 
 		 276 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  40.68 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  40.68 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  38.86 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>